Untuk mewujudkan Visi yang menjadi orientasi pembangunan Desa Kawunganten, telah ditetapkan misi sebagai landasan strategi implementasi yang bisa dituang dalam berbagai upaya penyusunan perencanaan tahunan (RKPD Desa) di lingkungan Desa Kawunganten, yang meliputi :

1.     Meningkatkan Kualitas sumber Daya Masyarakat yang Produktif dan Mandiri;

2.     Meningkatkan Sumber Daya Alam dan Ekonomi Desa dalam pembangunan Perekonomian Masyarakat;

3.     Meningkatkan Partisipasi Masyarakat Dalam Pembangunan;

4.     Meningkatkan Aparatur Pemerintahan Desa dan Lembaga Kemasyarakatan Desa dalam rangka Pelayanan Prima.